Основными задачами Департамента полиции и пограничной охраны являются:
- обеспечение внешней границы Европы;
- определение гражданства, выдача документов;
- обеспечение безопасности и общественного порядка внутри государства;
- производство в области правонарушений и их профилактика.
Более подробно основные задачи отделов расписаны в статуте департамента (на эстонском языке).